Grazie al significativo avvento negli ultimi dieci anni dell’elevata capacità di sequenziamento, è ora possibile dal punto di vita metagenomico definire lo spettro delle sequenze microbiche presenti nei campioni di sangue umano. Pertanto, il sequenziamento metagenomico appare come un approccio promettente per l’identificazione e la sorveglianza globale di nuovi virus emergenti e/o inaspettati che potrebbero compromettere la sicurezza della trasfusione del sangue.
Tuttavia, nonostante i considerevoli vantaggi rispetto ai metodi tradizionali di identificazione degli agenti patogeni, questo approccio non mirato presenta molti inconvenienti, tra cui una mancanza di sensibilità e problemi di contaminazione delle sequenze. Con ulteriori miglioramenti, specialmente atti ad aumentare la sensibilità, il sequenziamento dei metagenomici dovrebbe diventare in un prossimo futuro un ulteriore strumento diagnostico nel campo delle malattie infettive e in particolare nella sicurezza della trasfusione di sangue.
Transfus Clin Biol. 2017 Sep;24(3):218-222. doi: 10.1016/j.tracli.2017.06.018. Epub 2017 Jul 8.
The potential of viral metagenomics in blood transfusion safety.
Sauvage V1, Gomez J2, Boizeau L2, Laperche S2.